Они расходятся по важному вопросу, а именно по вопросу физической составляющей Иисуса Христа. «Деяния Иоанна» считают, что тела у Христа не было вовсе: Христос был надмирный дух, принявший облик человека. Напротив, «Деяния Фомы» полагают, что тело у Христа было, и это тело было не что иное, как тело Иуды Фомы! Надмирный дух не принял облик человека, а надел на себя физическое тело человека, как рубашку. Сначала он надел тело Иисуса, а потом – тело Иуды. Обе теологии являются гностическими. Но это две различных разновидности гностицизма, гностицизм